簡介
故事的主要舞臺是從東京都西部被分割出來的學園都市，其將東京西部佔據並佔有琦玉縣和神奈川縣一部分的圓形城市，這裡居住著230萬名人口，其中八成人口是學生的巨大都市。分為23個學區。和外部隔離，擁有領先世界20~30年以上的最尖端科技。“超能力開發”被列為學校課程的一部分，所有學生都接受超能力開發。根據能力不同，可以分為7級，從無能力（Lv0）到絕對能力（Lv6）。全世界都有合作組織。由“統括理事會”全權管理。為防止技術、超能力者外洩，對人口進出有嚴格的限制。都市不存在警察，取而代之的是從學生中挑選出的風紀委員（Judgement）和教師自願參與的警備員（Anti-Skill）維護治安，甚至可以作軍隊。名義上是日本一部分，實際幾乎是國中國。
故事的主人公上條當麻是這裡的一個無能力者，一直過著不幸的生活，但他並非完全沒有能力，而是他的能力是能夠將一切異能(包括超能和魔法)效果無效化，名叫幻想殺手。某一個暑假的日子，在家裡的陽臺上，他遇見了一位修女，這位少女自稱自己的名字叫禁書目錄（Index），從魔術的世界逃了出來，現在正在被魔法師追趕中。就這樣，上條當麻的命運被徹底改變。掌握了十萬三千本魔法書（魔導書）的少女與擁有抹殺一切幻想的“幻想殺手”右手的少年，將面臨一系列驚險故事。
番外：情書爭奪戰
相關連結：
《魔法禁書目錄（01-22）》
《新約魔法禁書目錄（01-04）》
《魔法禁書目錄SS1》
《魔法禁書目錄SS2》
《魔法禁書目錄SP》
《魔法禁書目錄特典：科學超電磁炮SS》
《魔法禁書目錄外傳：神裂篇》